1回戦 (2005/6/18-19,25-26)

ベイタル・エルサレム(イスラエル)6−4(4−3,2−1)シレクス・クラトヴォ(マケドニア)
ボヘミアンズ(アイルランド)2−3(1−0,1−3)ヘント(ベルギー)
ティリグル・ティラスポリ(モルドバ)2−9(0−3,2−6)ポゴニ・シュチェチン(ポーランド)
ヴァレッタ(マルタ)2−7(0−5,2−2)ブドゥチノスト・ポドゴリツァ(セルビア・モンテネグロ)
ナルヴァ・トランス(エストニア)1−2(0−2,1−0)ロケレン(ベルギー)
ヴィクトリア・ロスポール(ルクセンブルク)2−5(1−2,1−3)ヨーテボリ(スウェーデン)
ディナモ・ティラナ(アルバニア)3−5(2−1,1−4)ヴァルテクス・ヴァラジュディン(クロアチア)
スラヴェン・ベルポ(クロアチア)2−0(1−0,1−0)ドラヴァ・プトゥイ(スロベニア)
アララト・エレバン(アルメニア)1−9(1−3,0−6)ヌーシャテル・ザマックス(スイス)
CFRクルージュ(ルーマニア)7−3(3−2,4−1)ヴェトラ(リトアニア)
オリンピアコス・ニコシア(キプロス)0−16(0−5,0−11)グロリア・ビストリツァ(ルーマニア)
スカラIF(フェロー諸島)0−3(0−2,0−1)タンペレ(フィンランド)
ヴァシャシュ・ブダペスト(ハンガリー)0−2(0−0,0−2)ドゥブニカ(スロバキア)
ジャルギリス・ヴィリニュス(リトアニア)2−0(1−0,1−0)リスバーン・ディスティラリー(北アイルランド)
カルヴァン・エフラフ(アゼルバイジャン)1−4(1−2,0−2)レフ・ポズナン(ポーランド)
レンジャーズ(アンドラ)1−6(1−1,1−5)シュトゥルム・グラーツ(オーストリア)
バンガー(ウェールズ)1−4(1−2,0−2)ディナブルグ(ラトビア)
スメデレヴォ(セルビア・モンテネグロ)1−3(0−1,1−2)ポベダ・プリレプ(マケドニア)
ネマン・フロドナ(ベラルーシ)0−1(0−1,0−0)テスコマ・ズリーン(チェコ)
ロンバルド・パーパ(ハンガリー)3−1(2−1,1−0)グルジア・トビリシ(ジョージア)
インテル・トゥルク(フィンランド)4−0(0−0,4−0)IAアクラネース(アイスランド)

2回戦 (2005/7/2-3,9-10)

シグマ・オロモウツ(チェコ)1−0(1−0,0−0)ポゴニ・シュチェチン(ポーランド)
CFRクルージュ(ルーマニア)1−1(PK5−3)(1−0,0−1)アスレティック・ビルバオ(スペイン)
ヴォルフスブルク(ドイツ)5−3(2−2,3−1)シュトゥルム・グラーツ(オーストリア)
デポルティーボ・ラ・コルーニャ(スペイン)4−2(3−0,1−2)ブドゥチノスト・ポドゴリツァ(セルビア・モンテネグロ)
アンカラスポル(トルコ)1−4(0−4,1−0)ドゥブニカ(スロバキア)
スロヴァン・リベレツ(チェコ)7−2(5−1,2−1)ベイタル・エルサレム(イスラエル)
サンテティエンヌ(フランス)3−2(1−1,2−1)ヌーシャテル・ザマックス(スイス)
ヘント(ベルギー)1−0(1−0,0−0)テスコマ・ズリーン(チェコ)
ハンブルガーSV(ドイツ)8−2(4−1,4−1)ポベダ・プリレプ(マケドニア)
スラヴェン・ベルポ(クロアチア)4−2(3−2,1−0)グロリア・ビストリツァ(ルーマニア)
ロケレン(ベルギー)2−6(1−4,1−2)ヤングボーイズ(スイス)
ヴァルテクス・ヴァラジュディン(クロアチア)6−5(4−3,2−2)インテル・トゥルク(フィンランド)
タンペレ(フィンランド)1−0(1−0,0−0)シャルルロワ(ベルギー)
ロンバルド・パーパ(ハンガリー)2−4(2−3,0−1)ヨーテボリ(スウェーデン)
ジャルギリス・ヴィリニュス(リトアニア)3−2(2−0,1−2)ディナブルグ(ラトビア)
ランス(フランス)3−1(2−1,1−0)レフ・ポズナン(ポーランド)

3回戦 (2005/7/16-17,23-24)

デポルティーボ・ラ・コルーニャ(スペイン)4−0(1−0,3−0)スラヴェン・ベルポ(クロアチア)
エガレオ(ギリシャ)4−5(1−3,3−2)ジャルギリス・ヴィリニュス(リトアニア)
ボルシア・ドルトムント(ドイツ)1−1(1−1,0−0)シグマ・オロモウツ(チェコ)
ヤングボーイズ(スイス)3−5(2−3,1−2)マルセイユ(フランス)
ヴァルテクス・ヴァラジュディン(クロアチア)2−5(1−1,1−4)ランス(フランス)
ローダJC(オランダ)1−1(0−0,1−1)スロヴァン・リベレツ(チェコ)
ウニオン・レイリア(ポルトガル)0−3(0−1,0−2)ハンブルガーSV(ドイツ)
ヘント(ベルギー)0−2(0−0,0−2)バレンシア(スペイン)
ドゥブニカ(スロバキア)1−5(1−3,0−2)ニューカッスル(イングランド)
ラツィオ(イタリア)4−1(3−0,1−1)タンペレ(フィンランド)
ヨーテボリ(スウェーデン)0−4(0−2,0−2)ヴォルフスブルク(ドイツ)
CFRクルージュ(ルーマニア)3−3(1−1,2−2)サンテティエンヌ(フランス)

準決勝 (2005/7/27,8/3)

バレンシア(スペイン)4−0(4−0,0−0)ローダJC(オランダ)
ジャルギリス・ヴィリニュス(リトアニア)2−7(1−2,1−5)CFRクルージュ(ルーマニア)
シグマ・オロモウツ(チェコ)0−4(0−1,0−3)ハンブルガーSV(ドイツ)
デポルティーボ・ラ・コルーニャ(スペイン)4−2(2−1,2−1)ニューカッスル(イングランド)
ヴォルフスブルク(ドイツ)0−4(0−0,0−4)ランス(フランス)
ラツィオ(イタリア)1−4(1−1,0−3)マルセイユ(フランス)

決勝 (2005/8/9,23)

CFRクルージュ(ルーマニア)2−4(1−1,1−3)ランス(フランス)
デポルティーボ・ラ・コルーニャ(スペイン)3−5(2−0,1−5)マルセイユ(フランス)
ハンブルガーSV(ドイツ)1−0(1−0,0−0)バレンシア(スペイン)

2005−06シーズン インタートト・カップ総評(1回戦−決勝)
 2005−06シーズンのインタートト・カップ1回戦に出場したチームは42チームである。
 2回戦には1回戦の勝者21チームと1回戦をシードされた11チーム(デポルティーボ・ラ・コルーニャやヴォルフスブルクなど)が出場し、 16チームが3回戦に進出している。
 3回戦から出場する上位シード8チーム(ラツィオ、ニューカッスル、バレンシア、ボルシア・ドルトムント、マルセイユ、ローダJC、ウニオン・レイリア、エガレオ) でインタートト・カップに出場する全チームが揃うことになる。 3回戦ではこの8チームと2回戦を勝ち上がってきた16チームが対戦し、準決勝には12チームが進出した。
 決勝には準決勝を勝ち抜いた6チームが進出し、決勝で勝利を収めたハンブルガーSV(ドイツ)、ランス、マルセイユ(フランス) の3チームがUEFAカップへの出場権を獲得した。