1回戦 (2003/6/21-22,28-29)

SVパッシング(オーストリア)2−2(1−0,1−2)グルジア・トビリシ(ジョージア)
エンカンプ(アンドラ)1−7(0−3,1−4)リールセ(ベルギー)
スパルタク・トルナヴァ(スロバキア)2−7(1−5,1−2)ポベダ・プリレプ(マケドニア)
パルティザニ・ティラナ(アルバニア)3−3(2−0,1−3)マッカビ・ネタニヤ(イスラエル)
ブルノ(チェコ)3−3(1−0,2−3)コタイク・アボヴャン(アルメニア)
コペル(スロベニア)3−2(1−0,2−2)NKザグレブ(クロアチア)
ジャルギリス・ヴィリニュス(リトアニア)1−4(1−1,0−3)エルグリーテ(スウェーデン)
ジェールETO(ハンガリー)3−3(1−1,2−2)エトニコス・アカナス(キプロス)
ヴィデオトン(ハンガリー)4−5(延長)(2−2,2−3)マレク・ドゥプニツァ(ブルガリア)
オドラ・ヴォジスワフ(ポーランド)1−3(1−2,0−1)シャムロック(アイルランド)
タンペレ(フィンランド)2−2(1−0,1−2)チェアラゥル・ピアトラ・ネアムツ(ルーマニア)
スティエスカ・ニクシッチ(セルビア・モンテネグロ)4−1(3−0,1−1)ユニオン・ルクセンブルク(ルクセンブルク)
バンガー(ウェールズ)2−6(0−1,2−5)グロリア・ビストリツァ(ルーマニア)
OFKベオグラード(セルビア・モンテネグロ)8−3(3−0,5−3)ナルヴァ・トランス(エストニア)
ディナブルグ(ラトビア)1−2(1−0,0−2)ヴィル(スイス)
ポロニア・ワルシャワ(ポーランド)1−5(0−3,1−2)トボル・コスタナイ(カザフスタン)
ドゥブニカ(スロバキア)7−1(3−0,4−1)オリンピアコス・ニコシア(キプロス)
ダチア・キシナウ(モルドバ)5−1(4−1,1−0)GIゴェタ(フェロー諸島)
スロボダ・トゥズラ(ボスニア・ヘルツェゴビナ)2−2(PK3−2)(1−1,1−1)KAアークレイリ(アイスランド)
シャフティオール・ソリゴルスク(ベラルーシ)8−1(1−0,7−1)オマー(北アイルランド)
アリアンシ(フィンランド)2−1(1−0,1−1)ヒバーニアンズ(マルタ)

)OFKベオグラードvsナルヴァ・トランス戦は1stlegの80分に、 スタジアムにCSガスが噴射されて試合が中断したために、実際の試合結果(6−1でOFKベオグラードの勝利)を無効にし、 OFKベオグラードの3−0の勝利と認定された。

2回戦 (2003/7/5-6,12-13)

アクラティトス(ギリシャ)0−1(0−1,0−0)アリアンシ(フィンランド)
エルグリーテ(スウェーデン)4−4(3−2,1−2)ニース(フランス)
シノト(チェコ)4−3(1−0,3−3)OFKベオグラード(セルビア・モンテネグロ)
ラシン・サンタンデール(スペイン)2−2(1−0,1−2)ジェールETO(ハンガリー)
スロヴァン・リベレツ(チェコ)4−0(2−0,2−0)シャムロック(アイルランド)
トゥーン(スイス)3−4(2−3,1−1)ブルノ(チェコ)
ブレッシア(イタリア)3−2(2−1,1−1)グロリア・ビストリツァ(ルーマニア)
マレク・ドゥプニツァ(ブルガリア)1−3(1−1,0−2)ヴォルフスブルク(ドイツ)
シャフティオール・ソリゴルスク(ベラルーシ)3−5(1−1,2−4)チバリア・ヴィンコヴツィ(クロアチア)
シント=トロイデン(ベルギー)0−3(0−2,0−1)トボル・コスタナイ(カザフスタン)
ヴィレムU(オランダ)3−4(2−1,1−3)ヴィル(スイス)
ポベダ・プリレプ(マケドニア)2−3(1−1,1−2)SVパッシング(オーストリア)
スロボダ・トゥズラ(ボスニア・ヘルツェゴビナ)2−5(1−0,1−5)リールセ(ベルギー)
タンペレ(フィンランド)1−0(0−0,1−0)スティエスカ・ニクシッチ(セルビア・モンテネグロ)
ダチア・キシナウ(モルドバ)5−0(2−0,3−0)パルティザニ・ティラナ(アルバニア)
コペル(スロベニア)3−3(1−0,2−3)ドゥブニカ(スロバキア)

3回戦 (2003/7/19-20,26)

トボル・コスタナイ(カザフスタン)0−4(0−1,0−3)SVパッシング(オーストリア)
ペルージャ(イタリア)4−0(2−0,2−0)アリアンシ(フィンランド)
エガレオ(ギリシャ)4−5(2−3,2−2)コペル(スロベニア)
ナント(フランス)5−3(1−2,3−2)ヴィル(スイス)
ニース(フランス)0−1(0−0,0−1)ブレーメン(ドイツ)
ビジャレアル(スペイン)3−1(2−0,1−1)ブレッシア(イタリア)
ギャンガン(フランス)4−5(延長)(2−1,2−4)ブルノ(チェコ)
ダチア・キシナウ(モルドバ)1−3(0−1,1−2)シャルケ(ドイツ)
ラシン・サンタンデール(スペイン)1−3(0−1,1−2)スロヴァン・リベレツ(チェコ)
シノト(チェコ)0−3(0−1,0−2)ヴォルフスブルク(ドイツ)
タンペレ(フィンランド)1−2(0−2,1−0)チバリア・ヴィンコヴツィ(クロアチア)
ヘーレンフェーン(オランダ)5−1(4−1,1−0)リールセ(ベルギー)

準決勝 (2003/7/30,8/6)

ナント(フランス)0−1(0−1,0−0)ペルージャ(イタリア)
SVパッシング(オーストリア)5−1(4−0,1−1)ブレーメン(ドイツ)
ブルノ(チェコ)1−3(1−1,0−2)ビジャレアル(スペイン)
シャルケ(ドイツ)2−1(2−1,0−0)スロヴァン・リベレツ(チェコ)
ヘーレンフェーン(オランダ)2−1(2−0,0−1)コペル(スロベニア)
チバリア・ヴィンコヴツィ(クロアチア)1−8(1−4,0−4)ヴォルフスブルク(ドイツ)

決勝 (2003/8/12,26)

SVパッシング(オーストリア)0−2(0−2,0−0)シャルケ(ドイツ)
ヘーレンフェーン(オランダ)1−2(1−2,0−0)ビジャレアル(スペイン)
ペルージャ(イタリア)3−0(1−0,2−0)ヴォルフスブルク(ドイツ)

2003−04シーズン インタートト・カップ総評(1回戦−決勝)
 2003−04シーズンのインタートト・カップ1回戦に出場したチームは42チームである。前回に比べて参加チームが1チーム増えたが、 これはカザフスタンのチームが初出場(ヨーロッパの大会には昨シーズンから出場している)を果たしたためである。なお、カザフスタン代表のトボル・コスタナイはヨーロッパ・カップ初出場にもかかわらず、 3回戦まで進出するなど、大健闘を見せたといえるだろう。
 2回戦には1回戦の勝者21チームと1回戦をシードされた11チーム(ブレッシアやラシン・サンタンデールなど)が出場し、 16チームが3回戦に進出している。
 3回戦から出場する上位シード8チーム(ペルージャ、ビジャレアル、シャルケ、ブレーメン、ギャンガン、ナント、ヘーレンフェーン、エガレオ) でインタートト・カップに出場する全チームが揃うことになる。 3回戦ではこの8チームと2回戦を勝ち上がってきた16チームが対戦し、準決勝には12チームが進出した。
 決勝には準決勝を勝ち抜いた6チームが進出し、決勝で勝利を収めたペルージャ(イタリア)、ビジャレアル(スペイン)、 シャルケ(ドイツ)の3チームがUEFAカップへの出場権を獲得した。